Madrasah Aliyah Nurul Yaqin mengawali kiprahnya di dunia pendidikan Islam pada tahun 2010 di bawah naungan sebuah yayasan yang bergerak dengan semangat syi'ar dan kepedulian sosial. Berlokasi di Jalan Gunung Sari, Desa Badung, Kecamatan Proppo, Kabupaten Pamekasan, madrasah ini hadir sebagai jawaban atas kebutuhan pendidikan tingkat menengah atas bagi masyarakat di wilayah pedesaan dan perbatasan. Meski berdiri 7 KM dari pusat kecamatan dan 15 KM dari pusat kabupaten, jarak tidak menyurutkan langkah madrasah ini untuk terus berkembang, hingga pada tahun 2013 dilakukan langkah perubahan besar guna memodernisasi tata kelola lembaga demi mutu pendidikan yang lebih baik.

Komitmen dan kerja keras seluruh civitas akademika akhirnya membuahkan hasil nyata saat MAS Nurul Yaqin resmi menyandang status Terakreditasi B pada 17 November 2017 berdasarkan SK dari BAN-S/M Jawa Timur. Kini, dengan mengantongi nomor NPSN 69894893, madrasah telah mandiri dengan menyelenggarakan kegiatan belajar mengajar setiap pagi hari di atas bangunan milik sendiri. MAS Nurul Yaqin terus konsisten melangkah maju, mendedikasikan diri untuk mencetak generasi muda daerah yang tidak hanya cerdas secara akademik, tetapi juga kokoh dalam beriman dan bertakwa.